朱翊钧对于改土归流的政绩完成自然愿意花时间去等，但对于处置勾结叛军的士族可不愿意花时间去等其悔悟。
与杨应龙勾结的蜀地士族在大肆抄家逮拿的同时，锦衣卫通过埋伏在杨应龙的线人也查知了许多官僚士子在与杨应龙等叛军接触，要么受贿要么主动暗通消息。
朱翊钧因而有时候也会有朱元璋一样的感觉，即贪官恶官无论怎么杀总是杀不完。
明明他对待背叛朝廷的士族一向处置的很严，但还是会有个别官僚士子要与叛军暗中接触，也不知是心存侥幸想借机捞钱捞取政治资源，还是纯粹就是因为反对新政，纯粹就是想坏，反正现实总是这么荒诞。
但朱翊钧也没有因为严刑峻法不能让所有官僚士子敬畏而就放弃严刑峻法。
在他看来，虽然严刑峻法不能完全禁止，但至少还是能让大部分官僚士子不敢胡来的，而能够渐渐的让更多的官僚士子在潜移默化下知道守规矩，知道自己不是土皇帝，知道要有敬畏之心。
所以，对于这些被查出来的士族，朱翊钧依旧下令严惩。
“主犯车裂，从犯处斩。”
“家眷与九族皆连坐流放东澎府，以作开发东澎府府之用。”
“朝廷鼓励士族富户移居新辟疆域实边，一个个是求着都不去，宁肯冒着身败名裂的风险勾结叛军勾结外夷奴役压榨自己乡民，也不去边地行教化之道，那就只能借此机会逼着他们去！”
朱翊钧因而对蜀地勾结杨应龙的士族下达了这样的处置。
除此之外。
朱翊钧还在视朝之日，让人将被锦衣卫查出来与叛军有接触如受贿如卖情报的犯事官僚押到了朝堂上，而当着文武百官的面，对这些官员们说道：
“朕也不知道你们是傻还是真的坏，但朕很清楚的是，你们是宁肯背叛圣人教义，背叛朕，背叛朝廷，不顾自己列祖列宗的颜面，不顾自己亲族家人的下场，也要为有一点点的可以让天下汉人为两脚奴的希望而努力！”
“在为欲使同胞为奴这方面，你们的信仰最是坚定，坚定到不惜一切，似乎永不肯放弃，但是圣人的话，伱们不是从小就开始学吗，怎么就忘了？”
“得道者多助，失道者寡助。”
“仁义不施而攻守之势异也。”
“这些话，你们是忘记了，还是心里其实不愿意承认他是对的，觉得自己可以罔顾实际存在的真理，觉得天下之势能顺自己的意？”
“朕尚且不敢如此霸道。”
“你们反比朕还霸道，还要我行我素！”
朱翊钧说着就走回到了自己的龙椅上，且对在场还在干岸上的文武官员们：
“你们自己也看看，看看这些人，朕不知道你们当中多少人是真的心存大仁大义，有多少只是因为很聪明很会掩饰很会隐忍，以至于现在还没有露出狐狸尾巴。”
“但是你们今日都要给朕记住，想在自己同胞面前当老爷、当主子，必须要给其恩德，让其愿意放下天子子民尊严服侍你，否则就休想！”
“而这恩德，要么去海外为汉家建功立业挣得；要么就国内专心于一项事业，勤勤恳恳，富家惠民惠国！”
“都记住了吗？”
朱翊钧说后就沉声问道。
申时行等皆拱手道：“臣谨记！”
“记住就好，要真的记住！”
“朕不是不让你们有欲，不是不让你们做人上人，但必须是合乎新礼，若合乎新礼，朕会比谁都仁善，否则，朕只能照太祖所言。”
朱翊钧说着就站起身来：“金杯共汝饮，白刃不相饶！”
说毕，朱翊钧就下旨道：“将这些犯事官僚拖出去，明正典刑！”
“陛下饶命啊！”