这位自称“与拿破仑并肩作战过”的撒丁王国将领，很快就接替杜福尔成了自由联盟的总司令。
后者被以贻误战机等多项罪名关进了监狱等待战后审判，这还是约瑟夫·洛伊争取后的结果。
因为之前的战争中杜福尔处决的逃兵太多，其中自然不乏一些有背景的人，他们自然不会放过这个落井下石的机会。
这里的逃兵中包括畏敌不前的军官。
然而约瑟夫·洛伊却清楚杜福尔是无辜的，而且后者本身并不想参与这场战争，是前者请后者出山的。
所以约瑟夫·洛伊尽全力保住了杜福尔，不过死罪可免活罪难逃，一个终身监禁或者是流放是少不了了。
另一方面弗里堡和楚格两个投降的州已经撑不下去了，教会和正统派的财产已经刮得差不多了，平民更是已经压榨到了极限。
约瑟夫·洛伊知道必须是开源的时候了，于是乎他将矛头指向了阿尔高州和圣加仑州。
这两个州虽然选择在开战之前站在了自由联盟一方，但是他们并不属于自由州，而且有很多油水可刮。
阿尔高州和圣加伦州极力反对，因为圣加仑州的高层就是教会势力，但是反对无效，圣加伦和阿尔高被自由化了，他们不得不与楚格州和弗里堡州承担沉重的战争负担。
不过有压迫便有反抗，尤其是莫名其妙成了叛徒的楚格州人民，他们不但要承担巨额的战争费用，为战争提供物资和劳动力，就连自己的家园也成为了自由州和正统州交战的战场。
楚格州民众自发组织游击队，开始反抗自由联盟的统治，对那些将他们变成薪柴的高层进行了清洗。
弗里堡州同样不堪重负，他们的年轻人几乎都被征光了，值钱的东西和粮食也都被抢走了，城镇的居民开始逃向大山深处，成功开启了逆城市化进程。
阿尔高州的处境是最惨的，因为弗雷·荷洛赛根本就没把他们当人看。弗雷·荷洛赛打不过游击队，但是他不会承认。
于是乎阿尔高州的天主教徒就成了最好的替罪羊，再加上约瑟夫·洛伊的授意，他们被反复洗劫。
至于外国雇佣军更是不可能拯救敌对势力的民众，绝望的阿尔高民众想要反抗却没有武器，高层的集体叛变更让他们缺乏领导。
起义只能迎来更加凶狠的报复，想要活下去只能给弗雷·荷洛赛当兵，或者去山里找游击队，但双方都不拿他们当自己人，这些人中大多数还是逃脱不了炮灰的命运。
自由州新任的联邦总司令奥菲·兰诺一上任便决定对卢塞恩州发动总攻，战争进行的过程依旧是波澜不惊，没有悬念，没有波折，更没什么战术可言，双方比拼的是勇气和耐力。
而内战的双方显然都缺乏勇气和耐力，战斗总是打打停停，场面上甚至有些滑稽。
不过守城一方毕竟是居高临下占据着地利的优势，所以吃亏的总是攻城一方。
双方将领的水平更是存在着决定性的差距，比起只知道用人海战术冲锋的奥菲·兰诺，卡尔大公的策略显然更加合理。
猛攻了十几天之后，奥菲·兰诺终于发现自由州的士兵并不适合打攻坚战，他们的士气太低，往往在损失了一小部分人之后就会落荒而逃，而想把他们重新收拢在一起需要很长的时间。
于是乎奥菲·兰诺选择了和杜福尔相同的战法，自由州的士兵再次挖起了战壕。
随着时间的推移，整个瑞士的局势正在不断恶化。奥菲·兰诺同样被关进了监狱，约瑟夫·洛伊不得不向弗雷·荷洛赛妥协。