引起诸多争议的部曲制最后还是在商戢的强力支持下获得通过。
也因为部曲制，其他将领因为军权被变相剥夺而引起的小怨念也顷刻间烟消云散。最后的军队的改革方案，几乎完全按照商戢的提议进行，郡兵部分不再多述，主力部队部分，除禁卫军外，全军被分为二十四个战斗不团，分别编号为第一至第二十四战斗军团。
赵云、黄忠、刘猛、王舒、太史慈等原有的的主力武将都分别被授予主力军团军团长的职位。
当然，这个军团长职位是商戢军内部的说法，对外还是某某将军。
不同的军团，因为统帅的特性不同，军团内部的兵种配置也略有不同，导致不同的军团作战倾向不同。
以赵云为例，他所统帅的第二战斗军团，军团核心自然还是原来的数万银龙铁骑，其余配备的骑兵也多以轻骑兵为主，重装步兵比例是所有军团中最少的，战斗风格自然以奇袭、突袭为主，主张不动如山，侵略如火。
而以吕匡为军团长的第十三战斗军团则恰恰相反，在第十三战斗军团中，轻骑兵比例最少，且主要起到骚扰、侦查、试探作用.
军团中重装步兵数量最多，狂暴战斧、神刀近卫、寒冰战盾等占据主导地位，机动性是二十四个主力军团中最低的，但打有准备的阵地战，除了禁卫军团，没有任何一个军团有百分之百的把握能冲破第十三战斗军团的阵地。
类似的例子很多，还有以山蛮猛士山蛮步兵的晋级版、寒冰战弩为主，擅长山地战的第十六军团；以星耀强弓、幽魂鬼骑为主，神秘莫测极擅长夜战的第一战斗军团。
除了这二十四大战斗军团之外，还有部分特殊军团暂未纳入编制。
比如说柳氏统率的凤舞卫。
截至目前为止，凤舞卫的数量仍旧未突破五万之数，而且因为凤舞卫情况特殊，也不好与其它军队组合，故而商戢大手一挥，直接将凤舞卫纳入了禁卫军体系，仍旧由柳氏负责统领，四位禁卫军门牙将则无权过问凤舞卫事物。
在战斗军团之外，商戢也没忘记水师。
水师的战舰暂且不说，为了能实现跨海远征的计划，商戢还额外成立了两支水师陆上战斗兵团。