现在皇帝兼并了天下，明确了是非，确立了至高无上的地位。而有一些读书人仍然不识时务，不向现实学习，仍然坚持要去模仿古代，用以前的事情来指责现行的社会制度，四处造谣，惑乱百姓。
他们私自传授学问，一起批评国家的法令教化，听到法令下达，就各用自己的学说去议论，回家时在心里非难，出来时街谈巷议，在君主面前自我吹嘘，以此来沽名钓誉，标新立异，自认为超人一等，带着下面的一群信徒编造诽言谤语。这种情况不加以禁止，上则君主的权威下降，下则形成党徒互相勾结。所以臣认为必须禁止现在的这种情况。
臣建议，除了秦国史官写的书以外，其他各国的历史书一律销毁；不是博士官自己需要的藏书以外，民间所有藏的像《诗》，《书》，还有诸子百家的书，一律销毁。谁要聚众谈论诗书要杀头，以古非今要灭族，限定三十日，集中到郡县销毁。如果官员知情不报，按照同样的罪名处罚。令下三十日内，如果不执行，要罚做城旦。医药类的，农书，还有占卜用的书不算在内，除此之外，诸子百家的书全部毁掉，如果想要学法令，就到官吏那里学习。”
自大秦统一天下已经有九年之久，关于是否恢复分封制的辩论也持续了九年，到如今仍然没有停止的意思，始皇帝的忍耐也已经达到了极限，如果继续这样下去，各种思想便会泛滥，官府每推行一次政令都会受到抨击，难以施行，于是始皇帝也决定采用严厉的手段停止目前这种无休止的争论。
始皇帝此刻也不想再在这个问题上纠缠，严厉斥责道：“朕统一天下已经九年，你们这些迂腐的儒生竟然到现在还想着分封，是要把大秦江山再次搞得四分五裂吗？
丞相的建议是对的！朕要将天下之杂书烧尽，从此统一政令，使大秦天下永固！传朕诏令，即日起三十日以内销毁所有杂书，自此之后禁止私人讲学！违令者依法严惩！”
淳于越以头叩地，哭诉道：“陛下三思啊！大秦江山不能就这么毁了啊！”
始皇帝怒道：“朕念在你多年来忠心耿耿，一再忍让，如今竟如此不识时务，中伤国之大计，来人，将其打入大牢，处以宫刑！”
焚书令一出，天下读书人尽皆哗然，然而迫于朝廷的威严，都莫敢不从。
儒生刘庆私下对孔林说道：“焚书令一旦实施，恐怕诸子百家的典籍都要散逸了！我想私下收藏一些书籍，把儒学传下去。”刘庆和孔林二人都在朝中担任博士，因为都是齐人，平时非常要好。
孔林道：“如今皇帝下令，如果不焚书，就要伐作城旦，四年的刑期，白天站岗放哨，晚上修长城。这是你我这种读书人能忍受的吗？”
刘庆正色道：“孟子曰，‘鱼，我所欲也，熊掌，亦我所欲也。二者不可得兼，舍鱼而取熊掌者也。生，亦我所欲也，义，亦我所欲也。二者不可得兼，舍生而取义者也。’如今只是被罚做城旦就如此恐惧，我儒家真的就没有讲道义之人了吗？”
孔林非常惭愧，再拜道：“刘兄有何打算？我当尽力完成。”
刘庆道：“今日到焚书尚有数日时间，你我二人将《诗》、《书》重新抄录一遍，藏在不同的地方，如果有人告发就将原本交出，我去罚做城旦，请孔兄务必保全抄本！”
孔林非常佩服刘庆的义气之举，道：“一切都听从刘兄安排！”
于是二人通宵达旦，重新抄录一份，藏于墙壁之间。
不久，焚书令限止日期到，有人告发刘庆藏书，刘庆无奈将原本交出，其人被罚做城旦，一月后死于长城脚下。
孔林感念刘庆的遭遇，将《诗》、《书》完整的保存了下来。
焚书令实行之后，无论朝堂还是民间，都再也没有人敢公然议论朝政，特别是对于分封制，在表面上已经永远成为了过去时。