炸弹客已经逍遥了七年，每年都会发出挑战，用谜语的形式来提醒炸弹的位置。警方就算找到了炸弹，也得花费很多的时间才能拆掉，拆不掉就死。
佐藤的前男友本来是爆炸课的拆弹专家，因为队友被炸弹客炸死，才来到了刑事一课。他不想只做个拆炸弹的人，而是想要亲手抓住凶手为队友复仇。
可惜他低估了炸弹客的阴险，故意让他二选一。是知道下一个炸弹的位置，还是拆掉摩天轮里的炸弹？
最后他为了获得最后炸弹的位置，牺牲了自己。
炸弹客在最后三秒给他发来短信，他必须在三秒之内把信息转发出去，就没有时间拆弹了。
炸弹客就是要让所有人都知道警视厅根本就是一群无能之辈，他们谁也保护不了，他们只是废物。
至于证明了警视厅是废物之后有什么用，他可不管，反正就是要证明。这里面多少是有点私人恩怨的。
今年的炸弹客如约而至，第一个炸弹就在白鸟警官的车里，他坐上驾驶座就意识到了不太妙，因为在遮阳板上有一个纸条。他立刻意识到炸弹客又回来了，这个以挑战警视厅为乐趣的凶犯再次犯罪。
轰！
白鸟在千钧一发的时候跳车，但还是被炸伤了，昏迷之前告诉边上的佐藤：“他回来了，炸弹客回来了。”
少年侦探团就在一旁，也是没想到街上遇到熟人聊聊天，就遇到了爆炸。柯南一听白鸟说他回来了，表示谁？
这个是炸弹客已经嚣张了七年，七年前柯南还是个小学生，当然七年后他还是个小学生。
佐藤的犯罪值不由自主地飙升，因为如果抓住这个炸弹客，她真的会开枪。
警视厅收到了炸弹客的传真，新一轮的挑战开始了，又该是证明警视厅无能的时候了。这次他要让更多人知道警探的无能，所以把炸弹放在了各种高调的地方，到时候就会有电视台的人直播，事情会闹大，大家就都能知道警视厅的混蛋们只会保护自己，根本保护不了居民。
柯南看到了爆炸案自然是不可能轻易放弃，立刻帮忙调查。不过他也发现了高木的不安，高木可是非常好的警探，要是没有他的话，少年侦探团可得不到那么多情报，柯南也没办法获得帮助。
少年侦探团一有事情就会去找高木，柯南需要调查什么，也会用毛利小五郎的身份让高木调查。总之高木是一个非常好用的工具人，不能让他出事。
“高木警官，你好像心不在焉。”
“柯南，如果知道你在乎的人可能会做错事，那应该怎么办？”高木问道。
如果是以前，柯南肯定会斩钉截铁地说阻止对方。可是现在他不知道了，什么是对，什么是错？以前法律是对，违法是错，但现在却有些混蒙了。
柯南没有回答，反问道：“难道是警视厅里有人的犯罪指数升高了？是佐藤警官？”他立刻推理出了一切。
“是啊，我也很奇怪，这个案子一出现，佐藤的犯罪指数就已经逼近了临界值。”高木苦恼地说道：“我到底应该怎么办？”