等柯南醒来之后，他完全不记得自己和父亲对峙的事情了，也完全不知道父亲做实验的事情，又是父慈子孝的一家人。
柯南还是继续上学，然后帮小五郎破桉。他的队伍是越来越强的，fbi、公安、怪盗、财阀全是他的帮手，而组织这边却死一个少一个，而且还有很多叛徒。
此消彼长，柯南和组织的强弱一直在发生变化。一开始柯南一个人对抗整个黑衣组织，那叫一个压力山大。后来多了一个动不动就灰心的灰原哀，两个小朋友同样被组织压制。
但随着剧情发展，各种强者出现了，成为了柯南的队友。而组织是不断减员，而且二五仔也不少。这么一对比，感觉柯南的队伍已经完全不用害怕组织了，都能和组织硬刚了，接下来反而是组织畏首畏尾。
真的是战略撤退，战略僵持，战略反攻三步走。
“柯南的队伍太强了，组织这边压力很大。”杜兰说道。
“所以你想要强化组织？”迪妮莎表示杜兰一开口就知道他没憋好心。
“强化组织就算了，我想差不多应该让柯南的团队成为整个国家的敌人了。让他知道什么叫做道高一尺魔高一丈。”杜兰说道。
“可是《人类补完计划》非常有利于未来，柯南他们也得接受。你又怎么让他们反对呢？他们又不是既得利益者，没必要和计划死磕。”迪妮莎还是看得很清楚的。
“可以让他们知道我想做皇帝，他们肯定会反对的。”杜兰说道：“这样，我们先让宫野明美作为间谍潜伏到他们的队伍中，传播我要做皇帝的消息。”计划虽然是好的，但帝制肯定是不被接受的，这就有了对抗的基础。