但洪荒却并未因此而安宁，祖龙这段时间的听道，领悟了杀戮之道，机缘巧合下，更是得到了魔君蚩罗的一滴精血，服用之后，实力大增，开始又有了称霸洪荒的野心。
然而有称霸洪荒野心的，可不止祖龙，听过鸿钧道人传道之后，初凤实力大涨，牠同样有此心，初凤认为自己天空霸主，理应由自己来当这洪荒之主，因为鸿钧道人，根本无此野心，再加上许多“大能”这段期间纷纷闭关，这让牠看到了机会。
两族纷纷盯上了始麒麟一族，毕竟始麒麟家大业大，统治了大半的洪荒大地，而且这些地域，都非常富饶。
于是始麒麟遭到了两族的疯狂进攻，始麒麟几乎是打退了祖龙一族，然后又接着与初凤所率的，天空飞禽一族战斗，让他疲于应对。
不过幸好有巫族帮忙，始麒麟所统领的走兽一族，始终未曾出现什么大伤亡，毕竟巫族那一帮战斗狂，连始麒麟见了也极为头疼。
但是战争终于还是出现了倾斜，鸿钧道人的一声令下，勒令巫族不可参与其中，十二祖巫无奈之下，只得听令率众迁移，毕竟在他们眼中鸿钧一直是他们的守护者，所以他的话，巫族必须重视。
巫族的回撤，让祖龙一族与初凤一族大喜过望，毕竟两族都不愿意面对在巫族那群“战斗狂”，更何况他们身后不仅有三清道人，还有已经完全融合天道的鸿钧。
于是趁着巫族回撤之际，两族达成了一个协意，那就是联手灭了走兽一族，然后两族再争长短，以决定谁才是洪荒霸主。
祖龙与初凤的联手，以迅不及雷耳之势，杀了始麒麟，并灭了始麒麟一族，其余的走兽部属没了统帅，逃的逃死的死，再也不成气候了，虽然他们走兽一族还有庞大的基数，但是却缺少统帅，所以三族争霸，由始麒麟一族覆灭，暂时落下序幕。
但随后初凤飞禽一族，与祖龙鳞甲一族，又是一场漫长的拉据战。
这时洪荒上的不少“大能者”，皆是从悟道中醒来，不过他们并不插手，而是静观其变，毕竟祖龙、初凤两大先天混沌神兽，可不是他们招惹得起的。
但是帝俊与太一却看见了妖族崛起的机会，他们趁着两族酣战之际，迅速整合了麒麟的走兽一族。
妖族的这等动静，自然瞒不了两族，但却也未被初凤与祖龙放在眼中，在他们眼中帝俊与太一，根本不足与他们为敌，倒是巫族才让他们有些忌惮。
于是两族继续没完没了的撕杀，非要分出胜负，或许他们都没意识到，无休止的争战，让两族的数量急剧减少。
持久的战争，让祖龙非常爆燥，再加上飞禽一族还有个隐藏的元凰，让他彻底没了胜算，于是他做了一件天怒人怨之事。
祖龙寻到了混沌精铁，加以始麒麟一身之精粹，炼制一把绝世神兵，但是始麒麟的怨气太深，神兵始终不得成形，失去理智的他竟然下令族人以身殉剑。
祖龙自己并不知道，自从牠服用魔君精血过后，已受其“魔性”影响，渐渐变成了一个杀戮狂，更有了魔族那等唯我独尊之态。
始龙剑铸好之后，祖龙举全族之力，趁元凰即将诞子之际，连夜偷袭初凤，凭借着始龙剑之威，成功斩杀了初凤，并追杀元凰。
就在祖龙即将斩杀元凰之际，鸿钧道人出现了，他制止了祖龙，并且怪责于牠，言他杀戮太重，以触怒天道，令祖龙好好反醒，并且收走了始龙剑。
至此三族之战彻底告终。
祖龙鳞甲一族，虽是最后的胜利者，但却也几乎伤之殆尽，心灰意冷下的祖龙，令族人永镇四海，繁衍生息，不得再与其他种族争斗。
而祖龙自那一战后，再也没在洪荒现身，洪荒从此又迎来了一阵和平。
而妖族看到了机会，他们整合三族余众，在天外天开辟了新的居住之地，命为“天庭”。
而巫族也不甘示弱，在十二祖巫的带领下，他们占据了始麒麟原有的领地，开始了自由生活。