人类的“自由意志”，这起源于人类的一个神学概念：
早期人类处在“泛神论”“万物有灵”阶段的时候，人类对于“善”和“恶”的认识还是模模糊糊的，人类为了生存，按照本能行事。
但是人类发展出“多神论”或者是“一神论”的信仰与崇拜之后，却发现，神明没办法解决所有问题，即便人们一次又一次地向神明献上祭品，苦难还是在人世间时有发生。
为什么神没有办法庇佑所有人，会允许世上这么多苦难？
终于，一部分神学家提出了“自由意志”的概念：神赐予人类“自由意志”，让他们能够在善与恶之间做选择——这种意志被冠以“自由”之名，但理论上却是神赐的。
但事实上，人类确实是拥有意志、有欲望、有创造力，有时候也能够自由地满足欲望，做出选择。
那么，他们是什么时候真正摆脱了“神明”的影响，开始相信自己的力量？——很显然，这才是伊南需要去探索的，真正的“自由意志”。
它既不是科技树也不是市政树，它也没有外在的形态，例如雕刻在石柱上的法典之类可以提供线索。
它存在于虚无缥缈的人心和意识之中，它没有物质的表现形式。
所以丹尼尔一口断定：这是整个任务中，最抽象也是最困难的一部分。
但是，“自由意志”的起源又是极其重要的。毕竟站在现代社会来看，人类挣脱对“神”的依赖，转而相信自己，是历史上一系列伟大突破的基础。甚至是在今天，人类也还未“完全”拥有“自由意志”——这正是“重溯文明计划”将这个课题列为重中之重的原因。
伊南顿时苦着脸：“你这不是坑我吗？”
丹尼尔愕然。
伊南嘟哝：“这个世界上出现对神明的崇拜……一定程度上不也，因为我吗？”
她被人认作豌豆神的一刹那；
她指点播种下豆子，烧制出陶器；
她将权力从神庙转移到人间的王手中；
她做的这一切，不仅仅推动了文明的发展，也加深了人们对于神明的信仰，让他们相信，神明在这世上确实存在，在关键时刻能给予他们指点。
丹尼尔一只手托着下巴，平静地望着伊南。
突然，他轻轻地笑了起来，那对琥珀色的眸子里写满了温柔。
“我亲爱的伊南啊，你觉得你是作茧自缚了吗？”