作为医学院做的最多的手术，肠痈手术的发明如同一道闪电划过的人类医学史的漫漫长夜。而万历七年开发成功的天花疫苗，更是将医学院的名声推高到了不可思议的境界。京师官、民由此而对于医学的尊重，不仅发自肺腑，甚至神而圣之——朱翊钧作为皇帝，也被涂抹了一层金粉。
在朱翊钧的影响下，也是外科手术的需要，医学院的全体师生都穿特制白色衣袍。在京师街面，如果哪位医学院的学生出街时没有换衣服，那他一定会被热情的群众围住，不是给东西，就是问问题。
最夸张的一次，有个学生大意了，穿着制服出门买东西，一文钱没花出去不说，还被一个做过肠痈手术的屠户在脖子上挂了一只猪后腿。如果他胆敢不要，那屠子说了，当场就要给他来一个白刀子进去。那哥们吓得战兢兢的，在屠子热情的持刀护送下抱着猪腿返校，成为全校的笑谈——大伙儿笑归笑，一股自豪感和使命感却因之油然而生。
这种氛围，让医学院和现代医学在大明得到了长足的发展。良好的医风医德和基础医学教育，也迅速的普及开来。在李时珍严格的要求下，医学院在历史上第一次提出了完整的医学道德规范，即“救死扶伤的天职、慎独守密的操守、一视同仁的慈心。”
这三条规范的归纳和推广，更加快了医学发展的脚步。应该说，在朱翊钧的极端重视下，大明医学的发展，至少领先了全世界一百年以上——现在的欧洲医生，还处于放血疗法治百病的阶段。
张居正作为朱翊钧的助手，变法的主要推手之一，自身也直接享受到了变法成果——他于正月三十入院，次日pì • yǎn上就挨了一刀，二月十五日顺利出院，一身轻松。
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