在加密文件夹时，系统将询问是否要同时加密它的子文件夹。如果选择是，那它的子文件夹也会被加密，以后所有添加进文件夹中的文件和子文件夹都将在添加时自动加密。
二、解密文件或文件夹
步骤一：打开Windows资源管理器。
步骤二：右键单击加密文件或文件夹，然后单击“属性”。
步骤三：在“常规”选项卡上，单击“高级”。
步骤四：清除“加密内容以便保护数据”复选框。
同样，我们在使用解密过程中要注意以下问题：
要打开“Windows资源管理器”，请单击“开始→程序→附件”，然后单击“Windows资源管理器”。
在对文件夹解密时，系统将询问是否要同时将文件夹内的所有文件和子文件夹解密。如果选择仅解密文件夹，则在要解密文件夹中的加密文件和子文件夹仍保持加密。但是，在已解密文件夹内创立的新文件和文件夹将不会被自动加密。
以上就是使用文件加、解密的方法！而在使用过程中我们也许会遇到以下一些问题，在此作以下说明：
高级按钮不能用
原因：加密文件系统(EFS)只能处理NTFS文件系统卷上的文件和文件夹。如果试图加密的文件或文件夹在FAT或FAT32卷上，则高级按钮不会出现在该文件或文件夹的属性中。
解决方案：
将卷转换成带转换实用程序的NTFS卷。
打开命令提示符。
键入：Convert[drive]/fs:ntfs
(drive是目标驱动器的驱动器号)
当打开加密文件时，显示“拒绝访问”消息
原因：加密文件系统(EFS)使用公钥证书对文件加密，与该证书相关的私钥在本计算机上不可用。
解决方案：
查找合适的证书的私钥，并使用证书管理单元将私钥导入计算机并在本机上使用。
用户基于NTFS对文件加密，重装系统后加密文件无法被访问的问题的解决方案(注意：重装Win2000/XP前一定要备份加密用户的证书)：
步骤一：以加密用户登录计算机。
步骤二：单击“开始→运行”，键入“mmc”，然后单击“确定”。
步骤三：在“控制台”菜单上，单击“添加/删除管理单元”，然后单击“添加”。
步骤四：在“单独管理单元”下，单击“证书”，然后单击“添加”。
步骤五：单击“我的用户账户”，然后单击“完成”(如图2，如果你加密用户不是管理员就不会出现这个窗口，直接到下一步)。
步骤六：单击“关闭”，然后单击“确定”。
步骤七：双击“证书──当前用户”，双击“个人”，然后双击“证书”。
步骤八：单击“预期目的”栏中显示“加密文件”字样的证书。
步骤九：右键单击该证书，指向“所有任务”，然后单击“导出”。
步骤十：按照证书导出向导的指示将证书及相关的私钥以PFX文件格式导出(注意：推荐使用“导出私钥”方式导出，这样可以保证证书受密码保护，以防别人盗用。另外，证书只能保存到你有读写权限的目录下)。
保存好证书
注意将PFX文件保存好。以后重装系统之后无论在哪个用户下只要双击这个证书文件，导入这个私人证书就可以访问NTFS系统下由该证书的原用户加密的文件夹(注意：使用备份恢复功能备份的NTFS分区上的加密文件夹是不能恢复到非NTFS分区的)。
最后要提一下，这个证书还可以实现下述用途：
(1)给予不同用户访问加密文件夹的权限
将我的证书按“导出私钥”方式导出，将该证书发给需要访问这个文件夹的本机其他用户。然后由他登录，导入该证书，实现对这个文件夹的访问。
(2)在其也WinXP机器上对用“备份恢复”程序备份的以前的加密文件夹的恢复访问权限
将加密文件夹用“备份恢复”程序备份，然后把生成的连同这个证书拷贝到另外一台WinXP机器上，用“备份恢复”程序将它恢复出来(注意：只能恢复到NTFS分区)。然后导入证书，即可访问恢复出来的文件了。
Win98加密文件夹四法
一、文件夹属性法
在“Windows资源管理器”窗口，右键单击要加密的文件夹，单击“属性”，选中“隐藏”复选框。在注册表的“HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\explorer\Advanced\Folder\Hidden\SHOWALL”分支下，将“CheckedValue”的键值设置为数字“0”。以后，即使在“Windows资源管理器”窗口，单击“查看”菜单中的“文件夹选项”，单击“查看”选项卡，选中“显示所有文件”复选钮，也无法看到具有隐藏属性的文件夹。
二、“回收站”法
首先确认选中了“显示所有文件”复选钮，并且注册表中“CheckedValue”的键值为“1”。然后，在“Windows资源管理器”窗口，右键单击“C:\RECYCLED”文件夹(这是C盘上“回收站”对应的文件夹)，再单击“属性”，单击“常规”