因为钟楼之行，三个传教士的心灵都受到重创。利玛窦回去后就生了病，发高烧说胡话，把与之接洽的皇室代表徐光启忙乎够呛。
等利玛窦病好了，三个传教士如同霜打的茄子，都有些蔫吧。老老实实的按照徐光启给他们的教学任务，准备起教案来。
京师大学的开学季定在七月十八，范礼安等人既要忙乎新教堂建设，还要配合朝廷组建赴欧洲的使团，忙的脚打后脑勺。利玛窦作为汉语不流利的成员，就接过来教案编制的活儿，日夜与徐光启一同探讨，两人很快就成为无话不谈的好朋友。为了方便交流，徐光启还给利玛窦讨了一个文华殿的腰牌。
万历十年五月初七，乐平公主与徐光启成婚，教廷使团全数参加了这场婚礼，这也是使团第一次参加中国的社交宴会。婚宴之后，使团多人成了京师权贵的座上宾，传教大业向前猛地跨了一步。
六月初五，因太后召见女婿和乐平公主，徐光启放了利玛窦一天假。利玛窦午睡过后，正在家中写日记，徐光启却又上门道：“我听说你会弹琴，是吧。”
利玛窦点头称是，徐光启长出一口气道：“还好，我没有说错话。你快跟我来，皇上正在仁圣太后处，太后召见你能去演奏那个什么羽管琴。”
利玛窦闻言大喜，忙整肃衣冠。徐光启笑道：“你不穿教士袍子了？”利玛窦一边整理玉色襕衫，一边道：“你帮我看看，我这头巾戴的对吗？我跟范礼安老师说了，以后都穿大明衣冠。他们的那几套正在做呢。”
.......
说来奇怪，穿上大明衣冠之后，再见到皇帝和太后，磕头的心理障碍也没有了。见礼之后，利玛窦不敢抬头乱看，因为他已经身处慈庆宫，殿中花枝招展的，都是些后宫女子。
仁圣太后见了利玛窦的黄胡子，蓝眼睛，笑道：“还真是与我们人种不同，怪模怪样的。他可会说我们的话？”
利玛窦一脑门子汗：“我挺可以，说不行。”仁圣笑道：“你还挺可以！哈哈！”
朱翊钧在一旁笑道：“子先从去年开始学拉丁语，如今应答流利，让他做个通译。”说完，对徐光启竖起大拇指道，“你还真是个天才，朕已经学了两年，不如你。”